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基于單分子層技術研究哈維氏弧菌磷脂酶D對不同磷脂底物的吸附動力學——材料與方法

來源:中國油脂 瀏覽 220 次 發布時間:2024-07-29

磷脂酶D(Phospholipase D,PLD)(EC 3.1.4.4)是一類能水解磷脂質生成磷脂酸和羥基化合物的酶。除了具有水解活性外,PLD還可通過磷酰基轉移作用催化磷脂質極性頭部基團的轉移反應,從而將大量磷脂酰膽堿(PC)催化合成為自然界稀有的磷脂質,如磷脂酰乙醇胺(PE)、磷脂酰絲氨酸(PS)、磷脂酰甘油(PG)等。合成的磷脂質在食品、化妝品、藥品中具有重要應用價值。目前,磷脂酶D已成為合成和改造磷脂質的重要工具。從催化反應過程看,無論是催化磷脂質水解反應還是磷酰基轉移反應,由于磷脂酶D的反應底物是不溶于水的磷脂,因此與脂肪酶類似,磷脂酶D也屬于界面酶。界面酶催化水解反應的進程大致可分為兩步,首先水中游離的酶蛋白在脂質底物存在的條件下,從水相聚集到“脂質-水界面”上。其次,脂質底物進入酶蛋白催化活性中心,發生相應的催化反應,生成目的產物。已有研究表明,“磷脂質-水界面”的存在以及界面的質量對于磷脂酶D活力的充分發揮具有重要影響。而界面吸附作為酶催化反應的首要步驟,在該過程中發揮著重要作用。但目前對于磷脂酶D而言,大部分研究集中在利用其進行特定結構磷脂的合成,對于酶蛋白對脂質界面吸附特性的研究鮮有報道。


來源于哈維氏弧菌的磷脂酶D是新發現的一種酶,目前對于該酶的酶學特性尤其是該酶對不同磷脂底物的吸附動力學尚未見有相關報道。單分子層膜是目前公認的研究酶蛋白與脂質相互作用的經典模型。基于單分子層技術可實現脂質單分子層-水界面特性的精準控制,從而為分子水平研究酶蛋白在磷脂質-水界面上的吸附動力學奠定基礎。本研究首次利用單分子層技術研究該酶對不同磷脂底物的吸附動力學,以期深入了解該酶的界面吸附特性以及針對該酶進行開發與應用。


1材料與方法


1.1實驗材料


1.1.1原料與試劑


L-α-磷脂酰膽堿(≥97%)、L-α-磷脂酰肌醇(≥99%),L-α-磷脂酰絲氨酸(≥97%),L-α-磷脂酰乙醇胺(≥99%),L-α-磷脂酰甘油(≥98%),均購于Sigma公司;氨芐抗生素、pET21a表達載體、誘導劑IPTG,均購于Invitrogen公司;質粒提取試劑盒、BCA蛋白定量試劑盒,購于上海生工生物工程有限公司。其他試劑均為分析純。


1.1.2儀器與設備


葡聚糖凝膠G-25柱(1 000~5 000 Da,1 cm×20 cm,GEHealthcare Bio-Science AB),Q柱(5 mL預裝柱,嫁接葡聚糖的Seplite 6FF,配體—CH2N+(CH3)Cl-,粒徑50~150μm,流速300~500 cm/h,工作溫度4~40℃,pH范圍2~12,儲存緩沖液20%乙醇,溫度4~8℃),HYG-C型恒溫振蕩培養箱,JY92-IIN超聲破碎儀,Biologic LP蛋白層析儀(Bio-Rad公司),ELx800酶標儀(BioTek公司),Micro TroughX LB膜分析儀(配備有界面吸附專用反應槽,芬蘭Kibron公司),DTCZ-240N SDS-PAGE電泳儀,Triple TOF 5600 LC-MS質譜儀(美國AB SCIEX公司)。


1.2實驗方法


1.2.1失活型哈維氏弧菌磷脂酶D大腸桿菌重組表達菌株的構建


首先,從NCBI蛋白數據庫中下載哈維氏弧菌磷脂酶D的完整蛋白序列(GenBank:WP_005435673.1)。用在線信號肽分析軟件SignalP 4.1 server對其信號肽進行分析預測。去掉N端24個信號肽氨基酸后的蛋白序列稱為成熟蛋白序列。編碼磷脂酶D成熟蛋白(VhPLD)的基因序列委托上海生工生物工程有限公司參照大腸桿菌密碼子偏好性進行優化,同時在優化的基因序列N端和C端分別添加NdeI和XhoI酶切位點并進行全基因序列的合成。合成的VhPLD基因用NdeI和XhoI內切酶酶切后連入用相同內切酶進行酶切的pET21a表達載體。將構建的質粒pET21a-VhPLD轉化大腸桿菌DH 5α感受態細胞并進行測序驗證。為了避免酶水解磷脂從而對酶蛋白的吸附過程研究造成干擾,在已經構建的pET21a-VhPLD表達載體的基礎上進一步引入針對催化活性位點His157的單點突變(H157A),從而使表達酶蛋白喪失水解活性。單點突變體的構建采用重疊延伸法進行。將構建的突變體pET21a-VhPLD-H157A轉化大腸桿菌DH 5α感受態細胞并進行測序驗證。將測序正確的質粒進一步轉化到E.coliShuffleT7感受態細胞中,陽性克隆鑒定成功后,獲得失活型哈維氏弧菌磷脂酶D的大腸桿菌重組表達菌株。


1.2.2失活型VhPLD的表達與純化


將重組表達菌株接種于5 mL含有氨芐抗生素的LB液體培養基(0.5%酵母提取物,1%蛋白胨,1%NaCl)中,37℃下過夜培養,制備種子液。按5%接種量接種放大于含有氨芐抗生素的LB液體培養基中,37℃、200 r/min下培養2~3 h至OD600為0.6~0.8,加入誘導劑IPTG,至終濃度為0.05 mmol/L。調整培養溫度到20℃,繼續發酵培養24 h。將誘導表達后的發酵菌液離心(8 000 r/min,6 min,4℃),去上清液,菌體用50 mmol/L Tris-HCl、100 mmol/L NaCl(pH 8.0)重懸,超聲破碎15 min,離心(10 000 r/min,15 min,4℃),收集破碎上清,用0.45μm濾膜過濾。將收集到的破碎上清液進行Ni2+親和層析。蛋白上樣后,用Buffer A(50 mmol/L Tris-HCl,100 mmol/L NaCl,pH 8.0)沖洗,緊接著用Buffer B(含有100~500 mmol/L咪唑的Buffer A)進行梯度洗脫,收集出峰的蛋白樣品。將100 mmol/L咪唑梯度洗脫收集的出峰樣品用G-25柱脫鹽后,上樣Q柱陰離子交換層析,最終用含有300 mmol/L氯化鈉的緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl,pH 8.0)洗脫得到目的蛋白樣品。所得到的蛋白樣品經SDS-PAGE電泳檢測其純度,用BCA蛋白定量檢測試劑盒測定其蛋白濃度,用Triple TOF 5600 LC-MS(AB SCIEX)質譜儀進行LC-MS/MS鑒定分析。


1.2.3 VhPLD對不同磷脂單分子層吸附動力學參數測定


基于單分子層技術研究哈維氏弧菌磷脂酶D對不同磷脂底物的吸附動力學——材料與方法

基于單分子層技術研究哈維氏弧菌磷脂酶D對不同磷脂底物的吸附動力學——結果與討論

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